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经营所得只缴个人所得税。经营所得既要缴纳企业所得税，也要缴纳个人所得税。
1、个人独资企业免征企业所得税《国务院关于个人独资企业和合伙企业征收所得税问题的通知》（国发〔2000〕16号）规定，从2000年1月1日起，个人独资企业和合伙企业不再缴纳企业所得税，只对投资者个人取得的生产经营所得征收个人所得税。
目前，不少税种的相关规定赋予了纳税人税收选择权。比如在企业所得税方面，符合条件的企业重组可以选择特殊性税务处理或一般性税务处理;企业取得的符合条件的财政性资金，可以选择作为或者不作为不征税收入。在增值税方面，符合条件的纳税人可以选择一般计税方法或者简易计税方法;相关纳税人发生应税行为同时适用免税和零税率规定的，可以自主选择适用免税或者零税率。在个人所得税方面，居民个人取得的全年一次性奖金，可以选择并入或者不并入当年综合所得。
在征管方面，符合条件的纳税人，可以选择办理登记一般纳税人或小规模纳税人;纳税人多缴税款或依政策完成的退税申请获批后，可以选择抵减后续应纳税款或者直接退税;在办理个人所得税综合所得汇算时，纳税人可在自行办理、通过任职受雇单位代为办理、委托涉税专业服务机构或其他单位及个人办理三种方式中选择。
（1）个人独资企业。个人独资企业的投资者，它是以全部的生产经营所得为应纳税所得。税务局可以查阅工商变更信息， 个人独资企业需提前考虑投资和退出时需交的个人所得税，另外需要考虑个人投资者分红要交20％个税。
一、股权激励（股票期权为例）个人所得税处理
对因特殊情况，员工在行权日之前将不可公开交易的股票期权转让的，以股票转让净收入，作为“工资、薪金所得”征收个人所得税。这里的“股票期权的转让净收入”，一般是指股票期权转让收入，如果员工以折价购入方式取得股票期权的，可以将股票期权转让收入扣除折价购入股票期权时实际支付的价款后的余额，作为股票期权的转让净收人。此种情况下，不可公开交易的股票期权的购入方在行权购入股票时，不用再缴纳个人所得税。
员工行权（指不可公开交易的股票期权）时，其从企业取得股票的实际购买价（施权价）低于购买日公平市场价（指该股票当日的收盘价，下同）的差额，是因员工在企业的表现和业绩情况而取得的与任职、受雇有关的所得，应按“工资、薪金所得”适用的规定计算缴纳个人所得税。
《财政部？税务总局关于个人股票期权所得征收个人所得税问题的通知》（财税〔2005〕35号）《关于个人股票期权所得缴纳个人所得税有关问题的补充通知》（国税函〔2006〕 902号）《财政部 税务总局关于非居民个人和无住所居民个人有关个人所得税政策的公告》（财政部 税务总局公告2019年第35号）和《财政部关于个人所得税法修改后有关优惠政策衔接问题的通知》（财税〔2018〕164号）等文件做出了具体规定。
另外，对企业员工（包括在中国境内有住所和无住所的个人）参与企业股票期权计划，员工接受雇主（含上市公司和非上市公司）授予的股票期权，凡该股票期权指定的股票为上市公司（含境内、外上市公司）股票的，适用上市公司股票期权所得个人所得税相关税务处理规定。
第一条的规定内容：对符合条件的非上市公司股票期权、股权期权、限制性股票和股权奖励实行递延纳税政策。非上市公司授予本公司员工的股票期权、股权期权、限制性股票和股权奖励，符合规定条件的，经向主管税务机关备案，可实行递延纳税政策，即员工在取得股权激励时可暂不纳税，递延至转让该股权时纳税；股权转让时，按照股权转让收入减除股权取得成本以及合理税费后的差额，适用“财产转让所得”项目，按照20％的税率计算缴纳个人所得税。
二、股息分配（包括未分配利润、盈余公积转增）个人所得税政策
《财政部税务总局证监会关于实施上市公司股息红利差别化个人所得税政策有关问题的通知》（财税〔2012〕85号）规定，个人从公开发行和转让市场取得的上市公司股票，持股期限在1个月以内（含1个月）的，其股息红利所得全额计入应纳税所得额；持股期限在1个月以上至1年（含1年）的，暂减按50％计入应纳税所得额；持股期限超过1年的，暂减按25％计入应纳税所得额。上述所得统一适用20％的税率计征个人所得税。
《财政部税务总局证监会关于继续实施全国中小企业股份转让系统挂牌公司股息红利差别化个人所得税政策的公告》（财政部 税务总局 证监会公告2019年第78号）规定，个人持有挂牌公司的股票，持股期限超过1年的，对股息红利所得暂免征收个人所得税。个人持有挂牌公司的股票，持股期限在1个月以内（含1个月）的，其股息红利所得全额计入应纳税所得额；持股期限在1个月以上至1年（含1年）的，其股息红利所得暂减按50％计入应纳税所得额；上述所得统一适用20％的税率计征个人所得税。本公告所称挂牌公司是指股票在全国中小企业股份转让系统公开转让的非上市公众公司；持股期限是指个人取得挂牌公司股票之日至转让交割该股票之日前一日的持有时间。